Vida de bote

Uno de los 'padres' del genoma crea la primera célula artificial - La
técnica abre nuevos horizontes a la investigación de fármacos y genera
incertidumbres bioéticas

Diario EL PAÍS. Por Javier Sampedro 21/05/2010

Una ley inviolable de la biología -toda célula proviene de la división de
otra célula- ha regido la existencia y la evolución de todos los organismos
de la Tierra desde hace 3.500 millones de años. Hasta ayer.

La bacteria que acaba de salir de los laboratorios de Craig Venter es una célula, pero no proviene de otra, porque su
genoma es pura química: ha sido sintetizado en el tubo de ensayo de la
primera a la última letra. La materia inerte animada por el hombre -el mito
del golem- ya vive entre nosotros.

El científico planea diseñar un alga que convierta el CO2 en hidrocarburos
"Ha cambiado mi opinión sobre la definición de vida y su funcionamiento"

La primera "célula sintética" se llama Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0, para
distinguirla del Mycoplasma mycoides, que es la bacteria natural en quien se
inspira: la que le ha aportado no su genoma (que es de origen químico), pero
sí la información para fabricarlo (copiarlo).
Aunque la célula sintética no tenga una madre biológica, sí que tiene una
madre informática.
JCV es por John Craig Venter, y el 1.0 lleva su sello: denota que la célula
es sólo una primera versión y connota, o presagia, un futuro Sillicon Valley
del diseño de organismos vivos.
La reconstrucción de formas biológicas a partir de su mera información
genética -de una secuencia de letras de ADN escritas en un papel, o
almacenadas en una memoria- ya se había experimentado con virus, entre ellos
el de la polio y el de la gripe española de 1918. Pero los virus no son
entidades biológicas autónomas. Para reproducirse usan la maquinaria de la
célula a la que infectan. Aunque un virus puede tener solo tres genes, esa
maquinaria celular requiere cientos de ellos.
Es difícil predecir el alcance de esta tecnología. Entre los proyectos de
Venter está diseñar un alga -unicelular, como la mayoría de las algas
naturales- que fije el CO2 atmosférico y lo convierta en hidrocarburos,
utilizando la energía de la luz solar.

Otros proyectos buscan acelerar la producción de vacunas y mejorar la
producción de ciertos ingredientes alimentarios, y de otros compuestos
químicos complejos, o diseñar microorganismos que limpien aguas
contaminadas.
Pero estos fines empresariales conviven, de forma paradójica, con cuestiones
de profundidad . ¿Cuál es el genoma mínimo para sostener la vida? ¿Hay un
conjunto de secuencias genéticas que define la frontera entre lo vivo y lo
inerte? ¿Es esto una forma rampante de reduccionismo que pueda afectar a
nuestra concepción de la vida humana?
"Este es un paso importante tanto científica como filosóficamente", admitía
ayer Venter. "Ha cambiado mis opiniones sobre la definición de vida y sobre
cómo la vida funciona". El trabajo plantea otras cuestiones menos profundas,
pero apenas menos relevantes, sobre seguridad pública, bioterrorismo y
propiedad intelectual.
Por una vez, la bioética no tiene que salir corriendo detrás de la ciencia.
El propio Venter se ocupó de estimular la discusión desde el principio, y
algunos de los más respetados bioéticos del mundo llevan más de 10 años
analizando la cuestión. Entre ellos, Mildred Cho, del centro de ética
biomédica de la Universidad de Stanford, y Arthur Caplan, del centro de
bioética de la Universidad de Pensilvania. El grupo de trabajo también
incluye teólogos como Daniel McGee, de la Universidad de Baylor.
Han recopilado sus estudios en Synthetic Genomics Options for Governance
(disponible en www.jcvi.org/cms/research/projects/syngen-options/overview/
). Cho y Caplan publicaron un artículo de referencia en 1999 (Science 286:
2087).
Entre los ángulos polémicos del nuevo mycoplasma está su denominación. Los
autores lo llaman célula sintética, cuando solo su genoma lo es. Una vez
sintetizado el genoma, los científicos lo introdujeron en una célula (de
otra especie de Mycoplasma) a la que antes habían quitado su propio genoma.
Y un ser vivo no está hecho solo de genes. Las proteínas, los azúcares y las
grasas son fundamentales como componentes de la célula, y para procesar su
energía, o formar membranas.
Pero los azúcares y las grasas son sintetizados por enzimas, que son un tipo
de proteínas. Y las proteínas se ensamblan a partir de sus unidades químicas
(los aminoácidos) siguiendo el orden que dicta la secuencia de letras de los
genes. Por tanto, aunque la "célula sintética" original solo lo fuera a
medias, sus descendientes lo son por entero.
"Esta es la primera célula sintética que se ha hecho", dijo Venter, "y la
llamamos sintética porque la célula se deriva enteramente de un cromosoma
sintético, hecho con cuatro botes de productos químicos en un sintetizador
químico a partir de pura información guardada en un ordenador".
El trabajo, que adelanta hoy la revista Science en su edición electrónica,
es la culminación de un proyecto que empezó hace 15 años, cuando Venter y su
equipo hallaron un modo de estimar el genoma mínimo, la mínima información
necesaria para sostener la vida autónoma. Tomaron uno de los organismos con
el genoma más pequeño conocido, otro mycoplasma (Mycoplasma genitalium), que
vive en el tracto urinario humano. Le estropearon los genes uno a uno para
quedarse solo con los indispensables. Ese genoma mínimo suficiente para
sostener la vida resultó tener solo 350 genes. Ese fue el punto de partida
para el resto de la investigación, con esa y otras especies del género
Mycoplasma.
El genoma de un retrovirus, como el VIH, tiene unas 10.000 letras, o bases,
en la jerga. El de Mycoplasma mycoides, la madre informática de la célula
artificial, mide algo más de un millón de bases. Los genomas suelen medirse
en megabases, o millones de letras, así que el genoma de este mycoplasma
tiene una megabase. El genoma humano mide 3.000 megabases.
Las máquinas de sintetizar ADN están muy lejos de cualquiera de esas cifras.
Son muy rápidas y baratas, pero sus productos no pasan de 100 bases. El
equipo de Venter ha tenido que ensamblar esos fragmentos en una jerarquía de
pasos: primero en cassettes de 1.000 bases, luego en ristras de 10.000,
después en superristras de 100.000 y finalmente en la megabase total. Cada
paso requiere usar seres vivos naturales, lo mismo la bacteria Escherichia
coli, que la levadura del pan, Saccharomices cerevisiae.
El genoma sintético no es idéntico al natural. Tiene 14 genes menos, unas
pocas mutaciones ocurridas durante el largo procedimiento -todas
identificadas- y unas marcas de agua añadidas por los investigadores para
distinguirlo con certidumbre de la versión natural. Pese a todo, la célula
sintética Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0 se comporta como un Mycoplasma
mycoides cualquiera por cualquier criterio fisiológico o bioquímico.
Venter es una figura única en el panorama científico. Uno de los
investigadores más brillantes del proyecto genoma público, se hizo famoso al
montar un proyecto privado para competir con él. Cuando esta carrera acabó
-en empate-, Venter reasignó sus sistemas rápidos a secuenciar (leer las
letras del ADN gtaatct...) en masa la vida marina. Su actual empresa se
llama Synthetic Genomics. Uno de sus principales proyectos es energético:
diseñar un alga unicelular que genere hidrocarburos a partir de la energía
de la luz solar y el CO2 atmosférico.
Durante su exploración en masa de la vida marina, el equipo de Venter
descubrió miles de especies de microorganismos, y millones de nuevos genes.
El 85% de las secuencias genéticas son diferentes cada 350 kilómetros, y
muchas de las especies son únicas. Entre esos genes nuevos hay 3.000 para
fotorreceptores, las proteínas que captan la luz de distintas longitudes de
onda.
Una de las ideas de Venter es crear una bacteria artificial con una ristra
de esos genes y que capte así un espectro muy amplio de la luz solar. El
científico estima que una bacteria artificial de este tipo podría convertir
en hidrógeno un 10% de la energía solar, y que sembrarla en 13.000
kilómetros cuadrados bastaría para alimentar todo el transporte de EE UU. La
tecnología genética es capaz de multiplicar el rendimiento de un proceso
natural por 10.000 o 100.000 veces.